替换多列中的值

Question

这个问题以前被问过，但我的问题是非常具体，因此我张贴的问题。你知道吗

我有一个这样的文件：

chr10 100008748 100010821 2 2 1
chr10 100011459 100012109 2 2 1
chr10 100015496 100016536 2 2 1
chr10 100017921 100018765 2 2 1
chr10 100018985 100019147 2 2 1
chr10 100022808 100027387 2 2 0
chr10 100143625 100144703 2 2 1
chr10 100144824 100146957 2 2 1
chr10 100144941 100146957 2 2 0
chr10 100147064 100148110 2 2 1

我的任务是用“.”（句点）替换第6列的值，用+/-替换第5列的值。如果$5中的值为1，则为“-”或“+”。你知道吗

我尝试了一些python和perl脚本以及一些awk命令，但没有多少对我有用。你知道吗

如果您能给我一个假药，我将不胜感激，谢谢您的时间。你知道吗

**使用AWK**

BEGIN { FS=OFS=' ' } 
> $6 == "1" { $6 == "." }
> $6 == "0" { $6 == "." }
> 1
> ' Illumina_Heart_Gencode_AlignedSJ_cut.bed > test2.bed

awk '{ gsub(".",$6); print $1,$2,$3,$4,$5,$6}' Illumina_Heart_Gencode_AlignedSJ_cut.bed > test.bed

试图找到Perl和Python文件，但我想我删除了它们。你知道吗

Answer 1

通过awk

$ awk '{$6="."; if ($5==1){$5="-"} else $5="+"}1' file
chr10 100008748 100010821 2 + .
chr10 100011459 100012109 2 + .
chr10 100015496 100016536 2 + .
chr10 100017921 100018765 2 + .
chr10 100018985 100019147 2 + .
chr10 100022808 100027387 2 + .
chr10 100143625 100144703 2 + .
chr10 100144824 100146957 2 + .
chr10 100144941 100146957 2 + .
chr10 100147064 100148110 2 + .

它用.替换第6列的值，如果第5列的值是1，则用-替换第5列中的所有字符，否则用+替换所有值