我有一个多帧TIF文件,它记录了神经元荧光强度随时间的变化。 TIF文件有80 x 60像素和2000帧。你知道吗
我想分析每个像素荧光强度变化的频率,为此我需要定义帧的采样率。 现在我有一个三维数组,它有每帧像素的(x,y)坐标和z轴投影的帧数。 我已经用下面的脚本转换了3D numpy数组中的多帧TIF文件。你知道吗
from PIL import Image
import numpy as np
img = Image.open('C:/Users/Desktop/demoMovie.tif')
images = []
for i in range(2000):
try:
img.seek(i)
slice_ = np.zeros((80, 60))
for j in range(slice_.shape[0]):
for k in range(slice_.shape[1]):
slice_[j,k] = img.getpixel((j, k))
images.append(slice_)
except EOFError:
# Not enough frames in img
break
return np.array(images)
有没有什么方法可以在时间上转换帧数(z轴),它对应于帧速率的频率,这样我就可以分析每个像素的荧光强度频率?你知道吗
非常感谢你的帮助。你知道吗
目前没有回答
相关问题 更多 >
编程相关推荐