如何在python中实现“”呢？

Question

所以这个python代码是给我的。这意味着它的工作，但显然我有问题。我只是想知道有没有人能告诉我出了什么问题？你知道吗

当我试着跑的时候，错误总是发生

 intron1_length = ((my_dna.find(‘gtcata’)) –
 (my_dna.find(‘atcgat’)))

错误为“-”。只是不知道应该去哪里。谢谢！你知道吗

 # -*- coding: utf-8 -*-

 # We’ll start with “data-aware” way to do this first.
 # Since we have the sequence, we can see that exon 1 ends with
 # ‘GACTA’. We can use that information, and that method, for
 # finding the positions of the elements of this gDNA. This is NOT
 # an elegant solution, and would not work if we didn’t know the
 # DNA sequence ahead of time.

 my_dna = "ATCGATCGATGGTCGAATGACTAgtcatagctatgcatgtagctactc
 gatcgtattttattcgatcgatcgatCGATCGATCATGCTATCATCGATCGATATCGATGCATC
 GACTACTATgtcatggctatgcatcgatcgtattttattcgatcgttcgatGATCGATCGATCGACTGACTTTGAA"   
 # here we introduce another useful operator for strings: len
 gene_length = len(my_dna)
 # we’ll use the starting position of useful substrings in the
 # sequence to find the positions of the exon-intron boundaries.
 # We’ll then use those to find the length of each segment.
 exon1_length = (my_dna.find('Agtcata'))
 intron1_length =((my_dna.find('gtcata')) - (my_dna.find('atcgat')))
 exon2_length = ((my_dna.find('CGATCG'))- (my_dna.find('Tgtcatg')))
 intron2_length = ((my_dna.find('gtcatg'))- (my_dna.find('tGATCGA')))
 exon3_length = (gene_length(my_dna.find('GATCGA'))
 print ("Gene length:" + str(gene_length))
 print ("Exon1 length:" + str(exon1_length))
 print ("Intron1 length:" + str(intron1_length))
 print ("Exon2 length:" + str(exon2_length))
 print ("Intron2 length:" + str(intron2_length))
 print ("Exon2 length:" + str(exon3_length)) 

Answer 1

因为–！=-

你用什么来编辑你的代码？文字处理机？？你知道吗

这些引语看起来也可疑。使用一个不把这些放在代码中的编辑器。你知道吗

Answer 2

以下代码运行正常：

my_dna = """ATCGATCGATGGTCGAATGACTAgtcatagctatgcatgtagctactc
gatcgtattttattcgatcgatcgatCGATCGATCATGCTATCATCGATCGATATCGATGCATC
GACTACTATgtcatggctatgcatcgatcgtattttattcgatcgttcgatGATCGATCGATCGACTGACTTTGAA"""
# here we introduce another useful operator for strings: len
gene_length = len(my_dna)
# we’ll use the starting position of useful substrings in the
# sequence to find the positions of the exon-intron boundaries.
# We’ll then use those to find the length of each segment.
exon1_length = my_dna.find('Agtcata')
intron1_length = my_dna.find('gtcata') - my_dna.find('atcgat')
exon2_length = my_dna.find('CGATCG') - my_dna.find('Tgtcatg')
intron2_length = my_dna.find('gtcatg') - my_dna.find('tGATCGA')
exon3_length = gene_length - my_dna.find('GATCGA')
print ("Gene length:" + str(gene_length))
print ("Exon1 length:" + str(exon1_length))
print ("Intron1 length:" + str(intron1_length))
print ("Exon2 length:" + str(exon2_length))
print ("Intron2 length:" + str(intron2_length))
print ("Exon2 length:" + str(exon3_length))

我在打印语句中保留了括号，假设您使用的是Python3。您可能需要更改exon3_length行，因为我不清楚您的意图。你知道吗

要使代码运行，只需更改两个命令：

• my_dna的定义是多行字符串，因此需要三个引号。另一方面，如果您希望它是一个单行字符串，那么将它全部放在一行上。

• exon3_length行有两个问题：参数不平衡和试图调用整数。

解决这些问题后，代码将运行。你知道吗

代码中使用的引号和减号（与摘录相反）很好。运行代码不需要更改任何一个。

Answer 3

这是代码出错的部分：

exon3_length = (gene_length(my_dna.find('GATCGA'))

gene_length在前面通过调用dna字符串上的len被定义为整数。另外，括号不正确，缺少一个括号来关闭外部括号（这是多余的）。你知道吗