我(一年前)遇到这个讨论:https://github.com/bokeh/bokeh/issues/2392
我也看到了白色的屏幕,没有任何错误。然后我试着从2列中选取一小部分,并尝试了以下操作:
因为熊猫也只得到一堆空数据行,所以我尝试了dropna。。这导致根本没有数据。所以我只指定了应该进入df的行(因此是df = df.head(n=19)
行)
import pandas as pd
from bokeh.plotting import figure, output_file, show
df = pd.read_excel(path,sheetname,parse_cols="A:B")
df = df.head(n=19)
print(df)
rtngs = ['iAAA','iAA+','iAA','iAA-','iA+','iA','iA-','iBBB+','iBBB','iBBB-','iBB+','iBB','iBB-','iB+','iB','iB-','NR','iCCC+']
x= df['Score']
output_file("line.html")
p = figure(plot_width=400, plot_height=400, x_range=(0,100),y_range=rtngs)
# add a circle renderer with a size, color, and alpha
p.circle(df['Score'], df['Rating'], size=20, color="navy", alpha=0.5)
# show the results
#output_notebook()
show(p)
数据框:
Rating Score
0 iAAA 64.0
1 iAA+ 33.0
2 iAA 7.0
3 iAA- 28.0
4 iA+ 36.0
5 iA 62.0
6 iA- 99.0
7 iBBB+ 10.0
8 iBBB 93.0
9 iBBB- 91.0
10 iBB+ 79.0
11 iBB 19.0
12 iBB- 95.0
13 iB+ 26.0
14 iB 9.0
15 iB- 26.0
16 NR 49.0
17 iCCC+ 51.0
18 iAAA 18.0
上面显示的是笔记本中的一个输出,但仍然抛出:ValueError: Out of range float values are not JSON compliant
而且它也没有(因此?)同时生成输出文件。如何消除这个小子集的错误?是否与南价值观有关?这是否也能解决更大数据集的“死亡白屏”问题?
感谢vm的关注!
如果您希望看到整个错误:
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-4fa6b88aa415> in <module>()
16 # show the results
17 #output_notebook()
---> 18 show(p)
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in show(obj, browser, new)
300 if obj not in _state.document.roots:
301 _state.document.add_root(obj)
--> 302 return _show_with_state(obj, _state, browser, new)
303
304
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in _show_with_state(obj, state, browser, new)
310
311 if state.notebook:
--> 312 comms_handle = _show_notebook_with_state(obj, state)
313 shown = True
314
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in _show_notebook_with_state(obj, state)
334 comms_target = make_id()
335 publish_display_data({'text/html': notebook_div(obj, comms_target)})
--> 336 handle = _CommsHandle(get_comms(comms_target), state.document, state.document.to_json())
337 state.last_comms_handle = handle
338 return handle
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in to_json(self)
792 # this is a total hack to go via a string, needed because
793 # our BokehJSONEncoder goes straight to a string.
--> 794 doc_json = self.to_json_string()
795 return loads(doc_json)
796
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in to_json_string(self, indent)
785 }
786
--> 787 return serialize_json(json, indent=indent)
788
789 def to_json(self):
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\core\json_encoder.py in serialize_json(obj, encoder, indent, **kwargs)
97 indent = 2
98
---> 99 return json.dumps(obj, cls=encoder, allow_nan=False, indent=indent, separators=separators, sort_keys=True, **kwargs)
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\__init__.py in dumps(obj, skipkeys, ensure_ascii, check_circular, allow_nan, cls, indent, separators, default, sort_keys, **kw)
235 check_circular=check_circular, allow_nan=allow_nan, indent=indent,
236 separators=separators, default=default, sort_keys=sort_keys,
--> 237 **kw).encode(obj)
238
239
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\encoder.py in encode(self, o)
197 # exceptions aren't as detailed. The list call should be roughly
198 # equivalent to the PySequence_Fast that ''.join() would do.
--> 199 chunks = self.iterencode(o, _one_shot=True)
200 if not isinstance(chunks, (list, tuple)):
201 chunks = list(chunks)
C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\encoder.py in iterencode(self, o, _one_shot)
255 self.key_separator, self.item_separator, self.sort_keys,
256 self.skipkeys, _one_shot)
--> 257 return _iterencode(o, 0)
258
259 def _make_iterencode(markers, _default, _encoder, _indent, _floatstr,
ValueError: Out of range float values are not JSON compliant
好吧,这不完全是你问题的答案,更像是我与博克共事一周的经验。在我的例子中,我试图做一个类似德克萨斯州的例子,从博克。。。。。在经历了很多挫折之后,我注意到bokeh或json或其他什么东西,当遇到列表的第一个值(myList)被标绘为NaN时,它拒绝标绘给出消息
ValueError: Out of range float values are not JSON compliant
如果我将列表的第一个值(myList[0])更改为float,即使它包含NaN,也可以正常工作。考虑到这一点,理解这些事情如何工作的人会提出一个答案。我的方法是重构你的数据,这样第一个值就不是nan了。
合并this Pull Request以添加二进制数组序列化选项时,将更好地支持
NaN
支持。这应该在2017年1月的Bokeh0.12.4
中提供。Bokeh在pythonJSON
编码器中不使用allow_nan
,因为这不是标准的-nan
和inf
不是官方JSON规范的一部分(这是IMO的一个严重疏忽,但超出了我们的控制范围)我也有同样的错误,我调试了这个问题:我在绘制的数据集中有
NaN
个值,而bokeh
的serialize_json()
函数(在/core/json_encoder.py
)不允许NaN
个值(我不知道为什么…)。在这个函数的return
部分中,json.dumps()
中有allow_nan=False
参数(当生成输出文件(它调用上面的serialize_json()
函数)时,问题只出现在bokeh进程的io
部分)。因此,必须替换数据帧中的
NaN
值,例如:天气真好!:)
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