从转置的pandas数据框中选择系列

Question

使用数据帧，称为mrna，如下所示：

id      Cell_1  Cell_2  Cell_3
CDH3    8.006   5.183   10.144
ERBB2   9.799   12.355  8.571
...

如何选择ERBB2行作为一个系列（如果我不知道它的索引）？你知道吗

我试过： mrna.iloc['ERBB2']但这只需要一个整数，不映射到字符串

我也试过：

mrna_t = mrna.transpose()
mrna_t['ERBB2'] 

但我得到一个关键错误：“ERBB2”

Answer 1

传递一个布尔条件以生成一个布尔掩码，此掩码用于索引，并仅返回满足条件的行：

In [116]:
df[df['id']=='ERBB2']

Out[116]:
      id  Cell_1  Cell_2  Cell_3
1  ERBB2   9.799  12.355   8.571

布尔条件的输出：

In [117]:
df['id']=='ERBB2'

Out[117]:
0    False
1     True
Name: id, dtype: bool

至于您的错误：mrna_t['ERBB2']将尝试查找具有该名称的列，该名称不存在，因此KeyError

如果它是你的索引，那么你可以做：

df.loc['ERBB2']

要选择与传递的标签匹配的索引值，需要检查docs，包括index selection by position and label部分

Answer 2

我刚想出来。我只是重新设置索引标签然后换位。这使我能够通过“ERBB2”进行索引。你知道吗

mrna.set_index('id').T