python将多列文件读入数组

Question

我在读一个文件，它看起来像：

Protein in water
5826
300LEU      N 2945   7.972  16.153  13.055 -0.0183  0.4861 -0.4376
300LEU      H 2946   8.006  16.194  13.139  1.5894  1.3176 -1.4422
300LEU     CA 2947   8.017  16.020  13.016  0.1247  0.7136 -0.1096
300LEU     CB 2948   8.157  15.990  13.077 -0.0499  0.0576  0.0414
300LEU     CG 2949   8.273  16.081  13.032 -0.3927 -0.5342  0.1311
300LEU    CD1 2950   8.271  16.143  12.895  0.2232  0.1271  0.2677
300LEU    CD2 2951   8.281  16.197  13.136  0.0409 -0.0097  0.0710
300LEU      C 2952   7.917  15.908  13.047  0.5031  0.0949  0.0620
300LEU      O 2953   7.955  15.799  13.093 -0.2261 -0.5800  0.0226

我得把前两行去掉，分别读不同的专栏。 我试过这个：

 with open('file.txt') as fa:
     for line_aa in fa.readlines()[3:11]:
         line_aa = line_aa.strip()
         print line_aa
         col1,col2,col3,col4,col5,col6,col7,col8,col9 = line_aa.split('\t',9)

但我得到了以下错误：

300LEU      H 2946   8.110  15.548  13.027 -0.0632  0.8718 -0.8443
Traceback (most recent call last):
File "rmsd_cg_vs_aa.py", line 50, in <module>
col1,col2,col3,col4,col5,col6,col7,col8,col9 = line_aa.split('\t',9)
ValueError: need more than 1 value to unpack

我错过了什么？

Answer 1

如果要拆分制表符，请尝试拆分空白，而只使用：

str.split()

那你应该得到你想要的。

Answer 2

由于某些原因，“按拆分”只返回一个值，因此在尝试将该值应用于列1到列9时将引发错误。

试试这个：

print(len(line_aa.split('\t',9))

它印了一张对吧？

我建议您只使用空格而不是制表符：

col1,col2,col3,col4,col5,col6,col7,col8,col9 = line_aa.split(maxsplit=9)

Answer 3

我认为在这行中“300LEU H 2946 8.110 15.548 13.027-0.0632 0.8718-0.8443”。Python正在考虑将空格作为普通空格，而不是tab（\t）。请尝试打印空白的ascii（ord（））并确保它是'\t'。如果不使用正确的字符拆分字符串。也许你可以用空间分割并剥去它。