从Python函数调用C++函数

2024-09-30 20:26:54 发布

您现在位置:Python中文网/ 问答频道 /正文

在R中,我们可以使用Rcpp调用cpp函数,如下所示:

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
SEXP critcpp(SEXP a, SEXP b){
     NumericMatrix X(a);
     NumericVector crit(b);
     int p = XtX.ncol();
          NumericMatrix critstep(p,p);
     NumericMatrix deltamin(p,p);
     List lst(2);
         for (int i = 0; i < (p-1); i++){
            for (int j = i+1; j < p; j++){
               --some calculations
             }
          }
          lst[0] = critstep;
          lst[1] = deltamin;
          return lst;
}

我想在python中做同样的事情。 我经历过Boost,SWIG等,但在我的新手Python眼中,这似乎很复杂。 这里的Python巫师们能帮我指出正确的方向吗。 我需要从Python函数内部调用这个C++函数。在


Tags: 函数forincludeexportnamespacecppintusing
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-09-30 20:26:54

因为我认为唯一真正的答案是花一些时间重写你发布的函数,或者为这个函数编写某种包装器(绝对有可能,但相当耗时),所以我用一种完全不同的方法来回答。。。在

在不经过任何类型的编译转换的情况下,一种非常快速的方法(从编程时间的角度来看,而不是效率)可能是直接调用R解释器,其中包含您在python中发布的函数的模块,通过python rpy2模块,如here所述。它需要panda模块来处理R中的数据帧。在

要使用的模块(在python中)是:

import numpy as np  # for handling numerical arrays
import scipy as sp  # a good utility
import pandas as pd  # for data frames
from rpy2.robjects.packages import importr  # for importing your module
import rpy2.robjects as ro  # for calling R interpreter from within python
import pandas.rpy.common as com  # for storing R data frames in pandas data frames.

在代码中,应该通过调用importr导入模块

^{pr2}$

您可以通过发出以下命令直接向R发送命令:

ro.r('x = your.function( blah blah )')
x_rpy = ro.r('x')
type(x_rpy)
# => rpy2.robjects.your-object-type

您可以通过以下方式将数据存储在数据框中:

py_df = com.load_data('variable.name')

并通过以下方式推送数据帧:

r_df = com.convert_t_r_dataframe(py_df)
ro.globalenv['df'] = r_df

对于您的问题,这无疑是一个变通方法,但对于某些应用程序,它可能被认为是一个合理的解决方案,即使我不建议它用于“生产”。在

相关问题 更多 >