在R或matplotlib中獲取散點圖的優雅方法

Question

我有一份档案如下：

"ID"    "method1"   "method2"
"ABCD00005178"  -2.226646256    -2.14728
"ABCD00064724"  -2.460661389    -2.32005
"ABCD00169298"  -3.007943799    -2.00823
"ABCD00219070"  -2.68641563 -2.62434
"ABCD00220763"  -2.416688099    -2.38739
"ABCD00225740"  -2.36953104 -2.27758
"ABCD00226317"  -3.960254576    -3.92418
"ABCD00229829"  -3.564266939    -3.50151
"ABCD00229913"  -3.897553385    -3.98728
"ABCD00231004"  -3.507735931    -3.55717
"ABCD00231061"  -5.480421407    -5.38307
"ABCD00233156"  -2.363380193    -2.32521
"ABCD00233813"  -4.468308431    -4.30908
"ABCD00237623"  -4.113207121    -3.98899
"ABCD00241261"  -2.134610592    -2.03762
"ABCD00243457"  -3.558826293    -3.45873
"ABCD00248564"  -2.402259151    -2.08466

我试图在R中绘制一个散点图，如下所示。在

^{pr2}$

我得到了一个散点图，但我无法区分每个ID的两个数据点。我的文件包含超过1000行，我想显示从这两种方法获得的值是相似的还是不同的。任何帮助都将不胜感激。在

谢谢

Answer 1

每个点是“每个ID有两个数据点”。不完全是，x坐标是method1，y坐标是method2。要查看是否有关联，只需看看这些点是否与直线对齐。如果你需要一个统计测试，做一个线性回归。在

> x <- read.delim("temp.txt", header=T, sep=' ')
> plot(x$method1, x$method2)
> text(x$method1, x$method2, x$ID, cex=0.5)

线性回归：

^{pr2}$

颜色散点：

> plot(x$method1, x$method2, col=x$ID)