Pip、pip3和冲突的python发行版

Question

我在将python包PyTransit和ktransit安装到anaconda3（在Linux上）时遇到问题。似乎很多人都有类似的错误，但他们的解决方案都没有对我有效。有很多事情要做：

pip install ktransit给出：

/usr/bin/ld: /home/name/anaconda3/lib/libgfortran.a(pause.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.8' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

/home/name/anaconda3/lib/libgfortran.a: error adding symbols: Bad value
    collect2: error: ld returned 1 exit status

我会尝试使用./configure with--enable shared，但是没有配置文件。我尝试将extra_compile_args = ["-fPIC"], extra_link_args=["-fPIC"]添加到设置.py（如https://github.com/h5py/h5py/issues/851），但这没有任何作用。在

pip install pytransit给出了不同的错误：

^{pr2}$

这就是有趣的地方。使用pip3（或sudo pip）允许ktransit成功安装，但对pytransit没有任何作用。Pip和pip3似乎绑定在不同的地方：

which pip
/home/name/anaconda3/bin/pip

 which pip3
/usr/local/bin/pip3

which python
/home/name/anaconda3/bin/python

最后，当我试图通过anaconda在jupyter笔记本中导入ktransit时，它失败了，但是当我在jupyter QtConsole中导入ktransit时，它成功了，但似乎包含了它自己，并且没有提供实际的功能。我的意思是我不能引用模块中的任何内容，并且：

Help on package ktransit:

NAME
    ktransit

PACKAGE CONTENTS
    ktransit (package)
    setup

FILE
    (built-in)

我在想，无论python的哪个版本与/usr/bin相关联，都在某种程度上困扰着我……或者我的gcc或libgfortran有什么问题？我有gcc版本4.8.5和6（gcc——版本给出了4.8.5，但是-update备选方案说只有一个版本，6）。在

谢谢你花时间读到这里。我将非常感谢任何建议或想法！在

Answer 1

我卸载了Anaconda，确保python指向正确的方向，然后使用sudopython-mpip安装。感谢纳格夫逼我除掉Python！在