将原始数据保存为ti

Question

我需要分析一个图像的一部分，作为子矩阵，在tif文件中。我想有原始格式的图像，没有装饰（缩放，轴，标签等）。。。我怎么能那样做？

这是我现在使用的代码：

 submatrix = im[x_min:x_max, y_min:y_max]
 plt.imshow(submatrix)
 plt.savefig("subplot_%03i_%03i.tif" % (index, peak_number), format = "tif")

Answer 1

首先，如果您只想存储原始值或原始值的灰度表示，那么使用PIL进行存储是最简单的。

例如，这将生成一个10x10灰度tif文件：

import numpy as np
import Image

data = np.random.randint(0, 255, (10,10)).astype(np.uint8)
im = Image.fromarray(data)
im.save('test.tif')

至于你为什么matplotlib版本有更多像素的问题，是因为你含蓄地告诉了它。Matplotlib图形有大小（英寸）和dpi（默认情况下，屏幕上80个，保存时100个）。此外，默认情况下，imshow将对数组中的值进行插值，即使将插值设置为“最近”，保存的图像仍将是为图形指定的大小。

如果要使用matplotlib将图形以一个值保存到一个像素（例如，为了方便使用彩色地图），请执行类似的操作：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

dpi = 80 # Arbitrary. The number of pixels in the image will always be identical
data = np.random.random((10, 10))

height, width = np.array(data.shape, dtype=float) / dpi

fig = plt.figure(figsize=(width, height), dpi=dpi)
ax = fig.add_axes([0, 0, 1, 1])
ax.axis('off')

ax.imshow(data, interpolation='none')
fig.savefig('test.tif', dpi=dpi)