OSError:[Errno 24]使用Nibab打开的文件太多

Question

我有一个python3.6程序，使用nibabel包分析NIFTI格式的医学图像。

import glob
import nibabel as nib
health = [nib.load(pt) for pt in glob.glob(healthdir+'*.nii')] # len = 200
health_data = [h.get_data() for h in health]

它发生在最后一行OSError: [Errno 24] Too many open files。我使用了以下代码，发现它在最后一个元素中发生了错误。

^{pr2}$

我试过搜索相关的主题，比如 Nibabel: IOError: [Errno 24] Too many open files:。然而，这并不能解决问题。另外，我不喜欢使用ulimit。谢谢！

Answer 1

使用后可能需要删除该对象。在

def show_origin_image(name,s=100,max_limit=None, min_limit=None):
    origin = name
    file_name_list = [each for each in os.listdir(origin) if not each.startswith('.')]
    file_name_list = file_name_list[min_limit:max_limit]
    dimension = 2
    width_num = 6
    height_num = math.ceil(len(file_name_list) / width_num)
    plt.figure(figsize=(15, height_num * 2.8))
    data_list = []
    for n,each in enumerate(file_name_list, 1):
        agent = nib.load(os.path.join(origin, each), keep_file_open=False)
        three_d_data = np.asarray(agent.dataobj)
        size = three_d_data.shape
        image = np.take(three_d_data, s, dimension)
        plt.subplot(height_num, width_num, n)
        plt.imshow(image, 'gray')
        plt.axis('off')
        data_list.append(three_d_data)
        # add delete operation!
        del agent
    return data_list

Answer 2

不是尼伯尔家族成员，但请尝试with

    health_data = []
    for filepath in glob.glob(healthdir+'*.nii'):
       with nib.load(filepath) as health:
           health_data.append(health.get_data())

**未测试