将gsub命令从R转换成Python

Question

我想拆分这个mystring=“0G15^GAC0T60T4^AA0C0”，并使用python获得以下输出：

['0','G','15','^GAC','T','60','T','4','^AA','C']

可以使用R中的以下命令执行此操作：

^{pr2}$

如何将R脚本翻译成python？在

谢谢

Answer 1

你可以试试这个：

mystring="0G15^GAC0T60T4^AA0C0" 
import re
new_data = re.findall('(?<!\^[GAC])\d+|(?<!\^)\w|\^[a-zA-Z]+', mystring)
final_data = [a for i, a in enumerate(new_data) if a != '0' or not new_data[i-1].startswith("^")][:-1]

输出：

^{pr2}$

Answer 2

可以使用Pythons^{}模块重用现有的正则表达式

import re

mystring = "0G15^GAC0T60T4^AA0C0"
l = re.sub("([\\^]*[ACGT]+)[0]*", " \\1 ", mystring).split()

l则

^{pr2}$