在python中按第一列（或第二列或其他列）对文件排序

Question

这似乎是一个非常基本的问题，但我对python还不太熟悉，在花了很长时间试图自己找到解决方案之后，我想是时候问问更高级的人了！

所以，我有一个文件（示例）：

ENSMUSG00000098737  95734911    95734973    3   miRNA
ENSMUSG00000077677  101186764   101186867   4   snRNA
ENSMUSG00000092727  68990574    68990678    11  miRNA
ENSMUSG00000088009  83405631    83405764    14  snoRNA
ENSMUSG00000028255  145003817   145032776   3   protein_coding
ENSMUSG00000028255  145003817   145032776   3   processed_transcript
ENSMUSG00000028255  145003817   145032776   3   processed_transcript
ENSMUSG00000098481  38086202    38086317    13  miRNA
ENSMUSG00000097075  126971720   126976098   7   lincRNA
ENSMUSG00000097075  126971720   126976098   7   lincRNA

我需要写一个包含所有相同信息的新文件，但按第一列排序。

到目前为止，我使用的是：

lines = open(my_file, 'r').readlines()
output = open("intermediate_alphabetical_order.txt", 'w')

for line in sorted(lines, key=itemgetter(0)):
    output.write(line)

output.close()

它不会返回任何错误，但只是将输出文件与输入文件完全一样写入。

我知道这肯定是一个非常基本的错误，但如果你们中的一些人能告诉我我做错了什么，那就太神奇了！

非常感谢！

编辑

我在打开文件的方式上遇到了问题，所以关于已经打开的数组的答案并没有真正的帮助。

Answer 1

与SuperBiasedMan的想法相同，但我更喜欢这种方法：如果您想要另一种排序方式（例如：如果第一列匹配，则按第二列排序，然后按第三列排序等），则更容易实现

with open(my_file) as f:
    lines = [line.split(' ') for line in f]
output = open("result.txt", 'w')

for line in sorted(lines):
    output.write(' '.join(line), key=itemgetter(0))

output.close()

Answer 2

你的问题是你没有把每一行都变成一个列表。当你读入文件时，你得到的只是整个行的字符串。然后按每行的第一个字符进行排序，这始终是输入中的相同字符，'E'。

要按第一列排序，您需要将第一个块分割开来，然后阅读该部分。所以你的关键应该是：

for line in sorted(lines, key=lambda line: line.split()[0]):

split将把您的行变成一个列表，然后从该列表中获取第一列。

Answer 3

如果输入文件是制表符分隔的，也可以使用csv模块。

import csv
from operator import itemgetter
reader = csv.reader(open("t.txt"), delimiter="\t")

for line in sorted(reader, key=itemgetter(0)):
    print(line)

按第一列排序。

在中更改号码

key=itemgetter(0)

用于按不同列排序。