用python生成petsc二进制文件

Question

我试图用python创建一个PETSC二进制文件。我试图在bashshell上运行脚本，但是我得到了一个错误

$ python -c 'print file.shape\n import sys,os\n sys.path.append(os.path.join(os.environ['PETSC_DIR'],'bin','pythonscripts'))\nimport PetscBinaryIO\nio=PetscBinaryIO.PetscBinaryIO()\nfile_fortran=file.transpose((2,1,0))\n io.writeBinaryFile('my_geometry.dat',(walls_fortran.rave1()).view(PetscBinaryIO.Vec),))'

Unexpected character after line continuation character.

我知道这是因为有一个额外的\，但我的代码似乎没有任何。我尝试使用python-I以交互方式运行python，以找出代码的哪一部分有问题

^{pr2}$

我是python新手，所以我知道这可能是一个明显的错误。但我好像不知道这是怎么回事

谢谢约翰的回答。 现在它识别了PETSC_DIR，我得到了错误

 >>> PETSC_DIR="/home/petsc-3.4.3"
 >>> sys.path.append(os.path.join(os.environ["PETSC_DIR"],"bin","pythonscripts"))

     Traceback (most recent call last):
     File "<stdin>", line 1, in <module>
     File "/usr/lib64/python2.6/UserDict.py", line 22, in __getitem__
     raise KeyError(key)
     KeyError: 'PETSC_DIR'</code>

它不识别PETSC_DIR，即使我指定了它

Answer 1

为了举例说明，让我们从bash脚本中摘录一小部分：

python -c 'print file.shape\n import sys,os\n'

在bash单引号字符串中，“\n”表示后跟“n”的反斜杠。Python将其视为“额外的反斜杠”，即使您的意思是“\n”被解释为换行符。这就是生成类型错误的原因

^{pr2}$

要解决此问题，请尝试：

python -c $'print file.shape\n import sys,os\n'

Bash特别处理$'...'字符串，并将用python理解并知道如何处理的新行字符替换{}序列。在

（由于file没有shape属性，因此上述内容仍将给出一个错误。更多信息请参见下文。）

还有其他问题。以这段摘录为例：

python -c 'sys.path.append(os.path.join(os.environ['PETSC_DIR'],'bin','pythonscripts'))'

在bash引用removation之后，python看到：

sys.path.append(os.path.join(os.environ[PETSC_DIR],bin,pythonscripts))

这行不通，因为python需要引用PETSC_DIR和{}和{}（使用单引号或双引号：python不在乎）。试试看：

python-c'系统路径追加(os.path.join操作系统(操作系统环境[“PETSC_DIR”]，“bin”，“pythonscripts”））'

当bash在单引号中看到双引号时，它将不使用它们。因此，python将在需要的地方接收带引号的字符串。在

总之，在我看来，错误不是由python代码引起的，而是bash在将python代码传递给python之前对其所做的操作造成的。在

附录：至于print walls.shape()错误，其中walls是一个文件句柄，这个错误的意思是：文件句柄没有shape属性。您可能想使用os.path模块中的^{}函数来获得以字节为单位的文件大小？在