pandas：将空数据帧写入HDF-fi

Question

有没有办法强迫pandas将空数据帧写入HDF文件？在

import pandas as pd
df = pd.DataFrame(columns=['x','y'])
df.to_hdf('temp.h5', 'xxx')
df2 = pd.read_hdf('temp.h5', 'xxx') 

输出：

^{pr2}$

使用format='table'写入：

import pandas as pd
df = pd.DataFrame(columns=['x','y'])
df.to_hdf('temp.h5', 'xxx', format='table')
df2 = pd.read_hdf('temp.h5', 'xxx')

输出：

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File ".../Python-3.6.3/lib/python3.6/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 389, in read_hdf
    return store.select(key, auto_close=auto_close, **kwargs)
  File ".../Python-3.6.3/lib/python3.6/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 722, in select
    raise KeyError('No object named {key} in the file'.format(key=key))
KeyError: 'No object named xxx in the file'

熊猫版本：0.24.2

谢谢你的帮助！在

Answer 1

将空数据帧放入fixed格式的HDFStore应该可以工作（也许您需要检查其他包的版本，例如tables）：

# Versions
pd.__version__
tables.__version__

# DF
df = pd.DataFrame(columns=['x','y'])
df

# Dump in fixed format
with pd.HDFStore('temp.h5') as store:
    store.put('df', df, format='f')
    print('Read:')
    store.select('df')

>>> '0.24.2'
>>> '3.5.1'
>>>   x     y
>>>
>>> Read:
>>>   x     y

Pytable确实禁止这样做（至少是这样），但是对于fixed熊猫有它的{a1}。在

但正如在同一个github问题中讨论的，也有一些努力来修复table的这种行为。但看起来解决方案仍然是悬而不决的，因为它在march的结尾是这样。在