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运行终端程序多个输入文件上
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<p>我有一个运行在终端中的java程序,它以.txt作为输入,以.txt作为输出。我想在100个输入文件上运行这个程序。我怎样才能创建一个函数来获取所有输入文件并自动运行它们? 以下是java程序:</p> <pre><code>java -jar miraligner.jar -freq -sub 1 -trim 3 -add 3 -s hsa -i IsomiR_235G.txt -db ./DB/ -o Miraligner_235G.txt </code></pre> <p>下面是输入文件的样子,它们只是在<code>_</code>和{<cd2>}之间的部分不同</p> ^{pr2}$
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>另一种方法是直接获取文件名,而无需创建中间文件:</p> <pre><code>for f in IsomiR_*.txt do java -jar miraligner.jar -freq -sub 1 -trim 3 -add 3 -s hsa -i "$f" -db ./DB/ -o "Miraligner${f#IsomiR}" done </code></pre> <p>即使文件名包含空格、制表符或换行符,也可以这样做。在</p>
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