我试图遍历表中的行列表,并修改其中一列中的字符串:
# python 2.7
import csv
import re
with open('root_diff.txt', 'rU') as dmr:
coordinates_tsv = csv.reader(dmr, delimiter='\t')
coordinates_list = [row for row in coordinates_tsv]
for row in coordinates_list:
cut = re.split(':|-|r', row[3])
print cut[1]
但我得到了以下错误:
IndexError: list index out of range
row[3]
中的字符串如下:chr1:594572-598657
。
我想把它拆分成这样:['ch', '1', '594572', '598657']
,然后用第二个和第三个数字做一些事情。在
row[3]
必须至少有一个不包含要拆分的字符的值。在要调试,请捕获}以查看发生了什么:
IndexError
并打印cut
和/或{如果这是标题,请用
^{pr2}$next()
跳过它:注意,理论上,也可能是前面的行引发了这个异常;您没有在您的帖子中共享回溯。空行或列数较少的行将导致
IndexError
的row[3]
。例如,空行给出一个空列表。在相关问题 更多 >
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