擅长:python、mysql、java
<p>到目前为止,我发现的最好的方法是使用PDB_extract(<a href="http://pdb-extract.wwpdb.org/" rel="nofollow noreferrer">http://pdb-extract.wwpdb.org/</a>,联机或独立)将PDB文件转换为mmcif格式。</p>
<p>可以使用Biopythons解析mmcif文件生物数据库-模块。
编写mmcif文件有点困难,Python PDBx似乎工作得相当好。</p>
<p>这个和其他有用的PDB-/mmcif工具可以在<a href="http://mmcif.wwpdb.org/docs/software-resources.html" rel="nofollow noreferrer">http://mmcif.wwpdb.org/docs/software-resources.html</a>找到</p>