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用python(蛋白质结构文件)解析PDB头信息?
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<p>PDB文件(蛋白质数据库)是否有解析器可以从header/REMARK部分提取(大多数)信息,比如精化统计等等。?在</p> <p>值得注意的是,我主要感兴趣的是在文件生成后立即访问数据,而不是从已经存入蛋白质数据库的结构。这意味着要处理的“适当”格式有很多种,这取决于所使用的优化软件。在</p> <p>我已经看过Biopython,但他们在FAQ中明确指出:“如果您对PDB头的数据挖掘感兴趣,您可能需要查找其他地方,因为对此的支持非常有限。”</p> <p>我很清楚,从mmCIF文件中提取这些信息要容易得多,但不幸的是,这些信息还没有从许多大分子晶体学程序中常规输出。在</p>
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1 个回答
匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>也许你该去图书馆看看? <a href="https://pypi.python.org/pypi/bioservices" rel="nofollow">https://pypi.python.org/pypi/bioservices</a></p>
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