如何在python中以字符矩阵的形式打开文本文件？

Question

我有一个.fa文件，里面有一个核苷酸的秘密列表。是这样的

AGCTAGAGAGACTAGACTAGA

GATCAGTACATGATCTAGGAT

GATAGTACATGGGGGATAGAC

我需要以某种方式在python中打开文件，并生成一个二维数组，其中包含.fa文件的行，每列包含文件的一个字母。谢谢你的帮助！！！！在

Answer 1

如果您对矩阵是一个列表列表感兴趣，那么您可以通过列表理解来轻松实现。在

with open("myfile.fa","rt") as infile:
    matrix = [list(line.strip()) for line in infile.readlines()]
    print matrix

另一方面，如果您希望使用numpy矩阵（请注意，这要求您已经安装了numpy）：

^{pr2}$