水蟒图书馆错误与Jupyter笔记本电脑的R

Question

我正试图在Jupyter笔记本上写一些R代码（我也使用python，希望能够对所有事情都使用相同的应用程序），但是我遇到了一些问题。。。在

我在优胜美地。我安装了Anaconda3，更新了Jupyter，然后安装了RStudio（包括R essentials）。安装了r-irkernel（我想也是通过RStudio安装的），版本是0.8.11。在

当我试图在Jupyter中启动一个R笔记本时，它会启动一个内核，然后马上就死了。给出的错误是：

Kernel started: 4275a83e-b2b6-40ef-b161-3a7b2ac57c43
Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'pbdZMQ', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so':
  dlopen(/Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so, 6): Library not loaded: @rpath/libzmq.5.dylib
  Referenced from: /Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so
  Reason: image not found
Execution halted

请问最好的前进道路是什么？我错过了什么？在

谢谢！：）

Answer 1

试试看

conda remove zeromq
conda install zeromq

为我工作。在

Answer 2

唉！其他的答案都是关于水蟒的方法，所以我更笼统地讨论标题Jupyter notebooks for R?。水蟒很好，但总是有点落后。还有一个选项可以运行你的Jupyter R笔记本电脑，那就是Docker。

Jupyter Docker堆栈

Jupyter Docker堆栈包含Github和Docker hub中提供的Jupyter R笔记本here。在

你可以试试

$ docker run  rm -it -p 6780:8888 -v "$PWD":/home/jovyan/ jupyter/r-notebook 

在OS X或

^{pr2}$

在其他发行版中，或者作为操作系统需要设置的路径。在

您可能会发现以下线程很有用

1. Show volume files in the GUI of Docker Jupyter notebook

2. Kernel Error in R Jupyter Notebook due to Anaconda?

Answer 3

Alex Mikhalev的answer部分为我工作。不过，它也删除了笔记本电脑和r-essentials。在

他们的回答是：

conda remove zeromq
conda install zeromq

但是，我还需要安装以下组件：

^{pr2}$