以numpy数组的形式处理非常大的图像

Question

我正在处理大于8gb的.svs格式的图像。使用openslide，我将它们读作1D numpy数组。现在为了将它们输入到一个算法中，我需要将它们重塑成图像形式，以处理像素位置相关的信息。 由于图像非常大，使用PIL将numpy数组转换为

image=np.load('test.npy') 
im=Image.fromarray(image)

给我一个错误size does not fit in int。我试图通过将dtype从uint8改为uint64来解决这个错误，但是我的python仍然崩溃，尽管我的工作站上有64GB RAM and 3 TB memory。在

然后我尝试使用memmap加载numpy数组：

^{pr2}$

现在上面的代码给了我一个.tif格式的图像。但是，我无法处理。我无法分析原因？当我试着读那张图片并打印它的形状时，我发现了这一点。在

AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'shape'

所以，这种方式对我来说也是失败的。然后，我尝试将numpy数组重塑为（4433164625，3）图像的形状，得到以下错误

ValueError: sequence too large; cannot be greater than 32

有谁能帮我处理这样的图像吗。我有这些图像在x，y，z像素位置的注释，要将这些注释作为基本事实进行处理，我需要将我的numpy数组转换为图像形式。在

任何帮助都会很好。在

编辑：我现在正在重塑纽比阵列。但是，仍然不知道如何使用numpy文件作为我的数据集输入而不是图像。在