CSV Pandas DF Scipy的聚类矩阵

Question

我对熊猫相当陌生，对杂乱的集群也完全陌生。我有一个pandas数据帧，我在使用中读到pd.read_csv文件这是一个如下所示的矩阵（值表示彼此之间的距离：

    dog cat squ mea  che 
dog  0  .6  .5  .3    .2 
cat  1   0  .3  .7    .9
squ .6  .3   0  .3    .8    
mea .1  .1  .3   0    .9
che .4  .3  .4  .7     0

我想用scipy对我的矩阵进行聚类，最终创建一个具有层次/聚集聚类的树状图

^{pr2}$

但是我马上就遇到了这个值错误，不知道如何继续

ValueError: could not convert string to float: "'dog'"

我知道我没有正确地聚类这些矩阵，但不确定如何继续。在

Answer 1

只要第一列是索引，您的代码就可以很好地为我工作。加载数据帧时，按如下方式加载它，指定index_col=[0]将第一列指定为索引：

df = pd.read_csv(..., index_col=[0])

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^{pr2}$

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