数据到树状图和b

Question

我觉得这是一个很简单的问题，但我想不通。在

我有一个小的轨迹集，我正在尝试使用scipihcluster进行聚类。在

我在这方面很成功

    from hcluster import linkage, dendrogram

    l = linkage(matrix)
    d = dendrogram(l)
    show()

但是我不知道如何将树状图指定的颜色映射回原始轨迹。树状图有以下键['ivl'、'dcord'、'leaves'、'color\u list'、'icord']。根据文档，“ivl”是打印在图形底部的一组标签，这些标签无法阅读，因为字体很小。在

我试过以下方法

^{pr2}$

然而，这会爆炸，因为颜色列表中的颜色比ivl中的标签少一种颜色。当我看树状图时，我可以清楚地看到2个绿色，2个红色，3个洋红，等等，但是树状图告诉我的不是这样

    from collections import Counter        
    Counter(d['color_list'])
    Counter({'y': 68, 'b': 18, 'm': 2, 'c': 1, 'g': 1, 'r': 1})

最后我的问题。这个可怕的结构是什么？我如何通过树状图得到每个轨迹的颜色？在

Answer 1

我也发现了你的问题。希望你已经找到了答案，因为已经有几个月了，但如果其他人也遇到了这个问题： 可以使用函数fcluster来获取集群： http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.cluster.hierarchy.fcluster.html#scipy.cluster.hierarchy.fcluster

fcluster(Z,0.7*max(Z[:,2]),'distance')

应将fcluster参数与默认的树状图参数相匹配。在

希望这能奏效！在