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动态montecarlo/Gillespie算法的Python包
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<p>我正在研究一个描述蛋白质的模型。分子可能处于少数状态,从一种状态到另一种状态的转变是由包含跃迁速率的矩阵描述的。从常微分方程组的数值邻接矩阵开始求解。然而,为了得到过程的随机性,我想使用蒙特卡罗方法。据我所知,Gillespie算法就是为这个而设计的。对于这种任务,你有什么建议吗?在</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>您可以尝试使用<code>random</code>模块,自己执行montecarlo模拟,对初始邻接矩阵中的值使用随机浮点。只要确保随机选择一个数字在你的矩阵可以接受的范围内。在</p> <p>要迭代模拟,请使用<code>for</code>或<code>while</code>循环,具体取决于要运行的模拟数量。在</p>
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