我可以在Python中将defaultdict或dict转换为ordereddict吗？

Question

我试图解析一个fasta文件，然后我想创建另一个文件，它将包含fasta文件的所有可能的第100个ATGCN序列。在

例如：

chr1_1-100:ATGC.....GC  
chr1_2-101:ATGC.....GC  
chr1_3-102:ATGC.....GC  
......................  
chr22_1-100:ATGC....cG  
chr22_2-101:ATGC....cG  
......................

我用了以下代码：

^{pr2}$

问题是写入的文件不是有序。意味着它可以先包含chr10，然后再包含chr2。在

问题是因为解析是使用dict(完成的，例如SeqIO.to_dict(SeqIO.parse(open(i1), 'fasta'))。在

那么，我能把dict转换成有序的dict吗，这样我的文件就变得有序了吗？或者有没有其他方法可以解决这个问题？在

Answer 1

别费心做任何形式的口述。你不需要dict给你的属性，你需要dict转换丢失的信息。来自SeqIO.parse的记录迭代器已经为您提供了所需的：

with open(i1) as infile, open(out, 'w') as f:
    for record in SeqIO.parse(infile, 'fasta'):
        # Do what you were going to do with the record.

如果您需要dict键中的信息，那就是record.id。在