我创建了一个HDF5文件,显然没有任何问题,在Ubuntu 12.04(32位版本)下,使用Anaconda作为Python发行版,并在ipython笔记本中编写。底层数据都是numpy数组。例如
import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('myfile.hdf5','w')
group = f.create_group('a_group')
group.create_dataset(name='matrix', data=np.zeros((10, 10)), chunks=True, compression='gzip')
不过,如果我试图从新的iypthon笔记本打开此文件,则会收到一条错误消息:
f = h5py.File('myfile.hdf5', "r")
---------------------------------------------------------------------------
IOError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-4-b64ac5089cd4> in <module>()
----> 1 f = h5py.File(file_name, "r")
/home/sarah/anaconda/lib/python2.7/site-packages/h5py/_hl/files.pyc in __init__(self, name, mode, driver, libver, userblock_size, **kwds)
220
221 fapl = make_fapl(driver, libver, **kwds)
--> 222 fid = make_fid(name, mode, userblock_size, fapl)
223
224 Group.__init__(self, fid)
/home/sarah/anaconda/lib/python2.7/site-packages/h5py/_hl/files.pyc in make_fid(name, mode, userblock_size, fapl, fcpl)
77
78 if mode == 'r':
---> 79 fid = h5f.open(name, h5f.ACC_RDONLY, fapl=fapl)
80 elif mode == 'r+':
81 fid = h5f.open(name, h5f.ACC_RDWR, fapl=fapl)
/home/sarah/anaconda/lib/python2.7/site-packages/h5py/h5f.so in h5py.h5f.open (h5py/h5f.c:1741)()
IOError: Unable to open file (Unable to find a valid file signature)
你能告诉我丢失的文件签名是什么吗?我创建文件时有没有遗漏什么?
既然我们在对我问题的评论中解决了这个问题,我就把结果写在这里,把它标为已解决。
主要问题是我创建文件后忘记关闭它。有两个简单的选择:
或者,我的最爱,因为文件是自动关闭的:
我和https://github.com/matterport/Mask_RCNN一起工作时产生了相同的错误:
上面的解决方案对我也有效。我随机中断了培训,因此
.hdf5
文件没有正确关闭,之后无法打开。相关问题 更多 >
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