如何在Python中读取16Uint图像

Question

我有一个医学16无符号jpeg图像，我需要在python中阅读它。 这些图像只能用mathlab读取，对于我的项目，我需要读取它的实际像素值，并需要在这些值中进行一些数学运算。 您可以在下面的链接中找到该图像

https://drive.google.com/file/d/0B4l5GiM7kBXraDEyMXdseENfUlE/edit?usp=sharing

当我被要求在mathlab中获取图像信息时，下面的描述就来了。在

i = imfinfo('di.jpg')

i = 

       Filename: [1x56 char]
    FileModDate: '14-Jul-2014 15:22:13'
       FileSize: 1044064
         Format: 'jpg'
  FormatVersion: ''
          Width: 1024
         Height: 1024
       BitDepth: 16
      ColorType: 'grayscale'
FormatSignature: ''
NumberOfSamples: 1
   CodingMethod: 'Huffman'
  CodingProcess: 'Lossless'
        Comment: {'Created by AccuSoft Corp.'}

我已经使用matplotlib、opencv、scikitImage、scipy、medpy、PIL库来阅读python中的图像。 我看不懂这些类型的图像。在

当我在python中使用时，出现以下错误 代码： 导入图像 图像=图像.打开('日本邮政') 打印（图像）

^{pr2}$

请帮忙解决我的问题

Answer 1

这似乎是How we can read 16 un signed integer(16 uint) jpeg files in python的副本

我在https://drive.google.com/file/d/0B4l5GiM7kBXraDEyMXdseENfUlE/edit?usp=sharing上看过你的照片。很明显，这是一个16位灰度无损的JPEG图像，采用哈夫曼编码。然而，对于无损编码，至少有：

• JPEG无损（稀有、古老）
• JPEG-LS（相当罕见，不是很老）
• JPEG2000（更新）

有关这些的详细信息，请参见：http://en.wikipedia.org/wiki/Lossless_JPEG

cel在其注释中提到的GDCM库使用CharLS库来读取JPEG-LS。这个库确实有Python绑定，但不幸的是拒绝加载图像，因为它不是JPEG-LS文件。（但是，YMMV，见下面malat的评论。）

我还试图查询ImageMagick的identify，它提供了更多信息：

identify.im6: Unsupported JPEG process: SOF type 0xc3 `/tmp/di.jpg' @ error/jpeg.c/JPEGErrorHandler/316.

现在SOF类型在JPEG中很重要。错误消息表明，有问题的文件是一个“JPEG无损”文件。（这可能是因为它采用了哈夫曼编码）令人讨厌的是，在这种类型的文件中使用的编码方案与标准JPEG完全不同，而且标准JPEG库不支持它。在

似乎至少有两个开源库支持该文件格式：

• IJG的JPEG库版本6b（旧！）用特殊的补丁修补
• 托马斯·里克特的LibJPEG:https://github.com/thorfdbg/libjpeg

我尝试了后者，它的命令行工具确实识别了该文件并将其解码为更有用的文件（灰度PPM文件）。在

所以，这至少提供了一条路线。您必须编译并安装库，然后为其创建必要的Python绑定。或者，您可以将命令行工具用作外部转换工具，并使用subprocess来运行它们。最好的方法取决于你的平台。在