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比较两个制表符分隔的文件
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<p>这是一个与生物信息学相关的问题,但仍然是一个非常重要的编程问题。对于下面给出的问题,我未能在bash中构建一些行程序,因此我想在这里提出这个问题。请帮忙。在</p> <p>问题:我有两个文件(制表符分开)。文件A看起来像</p> <pre><code>chr1 17050255 234916798 chr1 36688211 36840408 chr1 153961765 154156955 chr1 154128722 154194653 chr1 154130378 154156872 chr1 207493679 207819735 </code></pre> <p>这是基因组坐标的列表。在</p> <p>文件B的前3列还包含基因组坐标,第4列有一个名称。在</p> ^{pr2}$ <p>我想要的是文件B的区域(以及第四列)与文件A重叠并打印成这样</p> <pre><code>ChrA StrtA stpA ChrB SrtB StpB Name </code></pre> <p>首先是文件A中的区域,然后是文件B中与其重叠的区域以及文件B中第四列的值</p> <p>谢谢你</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>我绝对建议您使用<a href="http://pandas.pydata.org/" rel="nofollow">pandas</a>来执行类似的操作。将两者都加载到单独的数据帧中,然后您应该能够以您希望看到的格式将它们合并在一起。在</p>
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