两个序列中相同对象的计数

Question

我很难尝试学习Python3，而现在我正为这个练习而挣扎。在

我要写一个函数，它有两个参数：

1）DNA序列的字符串。在

2）与参数1长度相同的字符串（也是DNA序列）

函数必须返回一个浮点数（两个DNA序列中相同碱基的比例）。在

因此，我知道我必须编写一个函数，它将返回如下内容：

seq_similarity("ATGC","AGTT")

应该回来

^{pr2}$

我只走了这么远，现在甚至在我开始之前就被困住了：

def sequence_similarity(seq1,seq2):
    seq1="AGTC"
    seq2="AGTT"

你能帮我开始吗？在

Answer 1

有一个内置的

  from difflib import SequenceMatcher

def similar(a, b):
    return SequenceMatcher(None, a, b).ratio()

Answer 2

您可以使用sum并给它一个条件：

sum(x==y for (x,y) in zip(seq1, seq2))

你的两根弦是3。在

然后除以长度：

^{pr2}$

如果使用2.x，请注意整数：

sum(x==y for (x,y) in zip(seq1, seq2))/float(len(seq1))