使用pythonigraph和mysql结果创建有向加权图

Question

我正在使用pythonigraph并尝试从MySQL查询结果生成一个有向加权图。我在数据集中的一个表上运行一个查询，我想基于它创建一个图。基本上，我的查询将返回以下内容：

A B Weight
1 2 3
2 4 5

有人能解释一下如何使用python igraph来实现这一点吗？有可能吗？在

Answer 1

假设您使用适当的DB-api2.0兼容MySQL模块直接从Python查询数据库，那么可以使用Graph.DictList方法来实现您的目标。^{}从字典表示的列表中创建一个图，在获取行时，可以配置MySQL查询游标生成字典而不是元组。这是未经测试的，因为我手头没有MySQL数据库，但它显示了一个总体思想：

import MySQLdb
import MySQLdb.cursors

conn = MySQLdb.connect(host='...', cursorclass=MySQLdb.cursors.DictCursor)

cursor = conn.cursor()
cursor.execute("SELECT source, target, weight FROM whatever")
graph = Graph.DictList(vertices=None, edges=cursor, edge_foreign_keys=('source', target'))

这里的重要部分是在连接到数据库时使用cursorclass=MySQLdb.cursors.DictCursor。上面的代码片段还利用了cursor是iterable的这一事实，因此它可能无法与其他数据库模块一起工作，但是使用一个通用的DB-api2.0游标并使其可以通过使用iter(cursor.fetchone, None)很容易。在

另外，请确保您在edge_foreign_keys中传递的两个列名与MySQL查询中包含源节点和目标节点的列的名称匹配。查询结果中的任何其他列都将另存为边属性。在