你能通过R Reticu安装Python包吗

2024-10-02 08:23:31 发布

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我将要在R中创建一个python接口,其中有一个包retricate。为了访问R中的python函数,需要安装相应的python包。在

我想到了两个问题:

1)如果使用网状包装,是否需要安装Python包装?还是只安装python包就足够了?在

2)是否可以在R中安装python包,类似于安装.packages(“r_包”)?在

有人对这个话题有经验吗?提前谢谢!在


Tags: 函数packages经验话题网状retricate
3条回答

1)R包reticulate可以与默认python或Anaconda2或{}一起工作。如果你想让水蟒和R一起工作,你必须先安装水蟒。安装后,调用library(reticulate),并运行py_config()或{},这将为您提供Python安装所使用的路径和环境列表。然后,一旦知道了Python路径,就在library(reticulate)后面添加一行这样的use_python("/opt/miniconda2/bin/python"),您就可以开始工作了。在

2)要安装Python包以便R(或netricate)可以看到它们,您必须从终端或控制台将它们作为常规Python包安装;而不是R。例如:conda install numpy安装numpy,或{}安装scipy,依此类推。在

我只是在Docker容器rocker/rstudio中完成所有这些。在标准操作系统中应该更容易。在

以下是分步说明:rstudio reticulate

干杯!在

我要在前面的答案上加一点细微差别。在

就像@f0nzie说的,Anaconda不是一个包,而是一个包管理器。理想情况下,您将使用Anaconda创建一个环境来帮助您进行包管理和版本控制。conda环境的文档是here。在

现在,您可以将python包安装到R中的anaconda包中。conda_install()的文档可以在here找到。在

如果您需要特定版本的Python模块,那么在模块名后面加上==,例如,下面将使用pip安装3个模块的特定版本:

reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
                            envname = "myenv", pip = TRUE)

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