访问.zip存档文件中的文件而不提取它们

Question

我试图读取.zip中的NIFTI文件，而不必将目录解压缩到根目录。更具体地说，我使用的是ADNI数据库，文件按subjectID存储在单独的.zip文件中。在.zip文件中有与该主题相关的所有数据，我想提取NIFTI文件（。广州)在.zip中，而不解压缩文件。在

目前我有以下代码片段

def openNIFTI(filename):
   return nib.load(filename).get_data()

zip_filename = filepath + str(subject_id) + '_3T_Structural_unproc.zip'
filename = str(subject_id) + '/unprocessed/3T/T1w_MPR1/' + str(subject_id) + '_3T_T1w_MPR1.nii.gz'

file = zf.extract(filename)
data = openNIFTI(file)

filepath是指向.zip文件集合的路径。filename是.zip文件中要提取的NIFTI文件的路径。在

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（编辑）

错误似乎来自于nibabel加载函数。然后进行功能检查

^{pr2}$

在测试os.path.exists（文件名）函数独立我发现。在

os.path.exists(r'C:/Users/eee/workspace_python/Image Reconstruction/data/ADNI/MRI data/100206_3T_Structural_unproc.zip/100206/unprocessed/3T/T1w_MPR1/100206_3T_T1w_MPR1.nii.gz')

False

但是，此路径是从我试图打开的文件复制/粘贴的。在我看来，错误出现是由于文件路径中的.zip，因为

os.path.exists(r'C:/Users/eee/workspace_python/Image Reconstruction/data/ADNI/MRI data/100206_3T_Structural_unproc.zip')

True

有别的办法吗？在

Answer 1

请参阅python: Open file from zip without temporary extracting it的公认答案这说明了如何在不提取文件的情况下从zipfile中读取数据（当然，您需要足够的RAM来处理文件内容）。在