用python进行DNA测序

Question

使用循环，我如何用python编写一个函数来排序最长的蛋白质链，而不考虑顺序。当ties与其他元素混合时，函数返回仅由字符“a”、“C”、“G”和“T”组成的子字符串：例如，在“accgxxcxgttactgggcxttgt”序列中，它返回“GTTACTGGGC”

Answer 1

如果数据是以字符串形式提供的，您可以简单地用字符“X”将其拆分，从而得到一个列表。在

startstring = 'ACCGXXCXXGTTACTGGGCXTTGT'
array = startstring.split('X')

然后，在检查元素长度的同时循环查看列表将得到正确的结果：

^{pr2}$

您还可以使用python内置程序以更有效的方式获得结果：

按降序长度排序（list.sort()）

startstring = 'ACCGXXCXXGTTACTGGGCXTTGT'
array = startstring.split('X')
array.sort(key=len, reverse=True)
print(array[0]) #print the longest since we sorted for descending lengths
print(len(array[0])) # Would give you the length of the longest substring

只获取最长的子字符串（max()）：

startstring = 'ACCGXXCXXGTTACTGGGCXTTGT'
array = startstring.split('X')
longest = max(array, key=len)
print(longest) # gives the longest substring
print(len(longest)) # gives you the length of the longest substring