Pandas数据帧到字典的多个键

Question

我目前使用的是一个由13个字母组成的列（“13mer”）与ID代码（“accessition”）组成的数据帧：

但是，我想创建一个字典，其中加入代码是关键字，其值是与加入相关的13mers，因此它看起来如下：

{'JO2176': ['IGY....', 'QLG...', 'ESS...', ...],
 'CYO21709': ['IGY...', 'TVL...',.............],
 ...}

我用这个代码完成了：

^{pr2}$

但是，现在我想返回并迭代每个加入代码的键，运行一个我定义为find_match_position（reference_sequence，13mer）的函数，它在引用序列中查找13mer并返回其位置。然后我想把这个位置作为13mer的一个值，它将是键。在

如果有人对我如何加快这个过程有任何想法，那将是非常有帮助的。在

谢谢

贾斯汀

Answer 1

我建议创建一个新字典，它的值是另一个字典。本质上是一个嵌套字典。在

position_nmers = {}
for key in H1_Access_13mers:
    position_nmers[key] = {} # replicate key, val in new dictionary, as a dictionary
    for value in H1_Access_13mers[key]:
        position_nmers[key][value] = # do something

要反省字典并确保它没问题：

^{pr2}$

Answer 2

通过解压缩，可以更清晰地遍历groupby：

d = {}
for key, s in df.groupby('Accession')['13mer']:
    d[key] = list(s)

这也使得你应该把你的函数放在哪里更清楚！在

。。。但是，我认为它可能更适合枚举：

^{pr2}$