使用来自其他Cython代码的自定义Cython代码

Question

我目前正在尝试优化我的Python程序，并开始使用Cython，以减少函数调用开销，也许以后还会包括优化的C库函数。在

所以我遇到了第一个问题：

我在代码中使用合成来创建一个更大的类。到目前为止，我已经将一个Python类转换为Cython（这已经足够困难了）。代码如下：

import numpy as np
cimport numpy as np
ctypedef np.float64_t dtype_t
ctypedef np.complex128_t cplxtype_t
ctypedef Py_ssize_t index_t

cdef class bendingForcesClass(object):
    cdef dtype_t bendingRigidity
    cdef np.ndarray matrixPrefactor
    cdef np.ndarray bendingForces

    def __init__(self, dtype_t bendingRigidity, np.ndarray[dtype_t, ndim=2] waveNumbersNorm):
        self.bendingRigidity = bendingRigidity
        self.matrixPrefactor = -self.bendingRigidity * waveNumbersNorm ** 2

    cpdef np.ndarray calculate(self, np.ndarray membraneHeight):
        cdef np.ndarray bendingForces
        bendingForces = self.matrixPrefactor * membraneHeight
        return bendingForces

在我编写的Python/Cython类中，我调用了类方法calculate，因此在我的组合类中我有以下（简化的）代码：

^{pr2}$

我发现cpdef使方法/函数可以从Python和Cython调用，这很好而且很有效，只要我不尝试预先定义self.bendingForces的类型，根据the documentation (Early Binding For Speed)这是必要的，以便消除函数调用开销。我尝试了以下方法，但没有效果：

from bendingForcesClass import bendingForcesClass
from bendingForcesClass cimport bendingForcesClass

    cdef class membraneClass(object):
        cdef bendingForcesClass bendingForces

        def  __init__(self, systemSideLength, lowerCutoffLength, bendingRigidity):
            self.bendingForces = bendingForcesClass(bendingRigidity, self.waveNumbers.norm)

        def calculateForces(self, heightR):
            return self.bendingForces.calculate(heightR)

在尝试用Cython构建membraneClass.pyx时，我得到了一个错误：

membraneClass.pyx:18:6: 'bendingForcesClass' is not a type identifier
building 'membraneClass' extension

请注意，声明位于两个单独的文件中，这使得这一点更加困难。在

所以我该怎么做？如果有人能给我一个指针，我会非常感谢，因为除了上面给出的链接之外，我找不到任何关于这个的信息。在

谢谢并致以诚挚的问候！在

Answer 1

这些可能不是错误的来源，但为了缩小问题的范围，您可以尝试更改以下内容：

可能是您在这里使用bendingForces作为变量名：

cpdef np.ndarray calculate( self, np.ndarray membraneHeight ) :
      cdef np.ndarray bendingForces
      bendingForces = self.matrixPrefactor * membraneHeight
      return bendingForces

这里还有成员对象的名称：

^{pr2}$

另外，bendingForcesClass是模块和类的名称。最后，从类bendingForcesClass生成一个ctypedef怎么样？在