int（）的文本无效，以10为基数的“0 | 0”错误？

Question

我得到一个错误：以10为基数的int（）的文本无效'0 | 0'。我不确定问题是格式0 | 0而不是0:0，因为它看起来像是用“：”分隔字段，还是与自我深度位置. 回溯显示：

Traceback (most recent call last):
  File "vcftopf_p1_commandline.py", line 200, in <module>
snps[i]=snp(lin)
  File "vcftopf_p1_commandline.py", line 140, in __init__
if int(gtype[self.depthpos])>=cutoff:                                   
ValueError: invalid literal for int() with base 10: '0|0'

一段代码看起来像：

^{pr2}$

输入如下：

#CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG01112 HG01113 HG01119 
1       14674   .       G       A       100     PASS    .       GT      0|0     0|0     0|0     

Answer 1

需要使用字符串调用eval

int(eval("0|0"))

结果：1