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如何迭代一个DNA代码串中每一个[:2]个重叠字符?
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<p>假设我有一串DNA“gaaggaggcgccccaagtgagagagaggcagctagaggcgggtaaccggca”</p> <p>考虑前5个字母:GAAGG</p> <p>我想把每一个重叠的双字母'GA'、'AA'、'AG'、'GG'替换成与它们出现的可能性相对应的数字,并将它们相加。比如‘GA’=1,‘AA’=2,‘AG’=0.7,‘GG’=0.5。所以对于GAAGG,我的sumAnswer=1+2+.7+5。在</p> <p>所以在psedoo代码中,我想。。。 -在我的DNA串中的每一个重叠的双元组上迭代 -找到每个唯一双gram对的对应值 -迭代求和每个值</p> <p>我不太确定如何迭代每一对。我以为for循环可以工作,但这并不能解释重叠:它打印每2对(GAGC=GA,GC),而不是每个重叠的2对(GAGC=GA,AG,GC)</p> <pre><code>for i in range(0, len(input), 2): print input[i:i+2] </code></pre> <p>有什么提示吗?在</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>只需将范围内的<code>,2</code>去掉,并确保不会到达字符串的末尾:</p> <pre><code>for i in range(0, len(input)-1): print input[i:i+2] </code></pre> <p><code>,2</code>告诉Python在每次迭代中向前推进两步。如果忽略它,则默认为向前迈进一步。在</p>
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