在pygraph中使用超图，需要验证示例

Question

我试图在pygraph中使用超图，下面是我插入的一个简单示例：

hgr = hypergraph()
hgr.add_nodes(["A1", "B1", "C1", "D1"]) 
hgr.add_nodes(["A2", "B2", "C2", "D2"])
hgr.add_nodes(["A3", "B3", "C3", "D3"])
hgr.add_nodes(["A4", "B4", "C4", "D4"])

hgr.add_hyperedge(("A1", "A2", "A3", "A4"))
hgr.add_hyperedge(("B1", "B2", "B3", "B4"))
hgr.add_hyperedge(("C1", "C2", "C3", "C4"))
hgr.add_hyperedge(("D1", "D2", "D3", "D4"))

h_dot = write(hgr)
h_gvv = gv.readstring(h_dot)
gv.layout(h_gvv,'dot')
gv.render(h_gvv, 'png', 'hypergraph.png')

我得到的图片是（点击查看全尺寸版本）：

请验证这是使用pygraph创建超图的正确方法。在

非常感谢！在

Answer 1

由于每个超边缘不是节点的集合，而是表示为一个节点，因此应该对hyperedges使用唯一（简单）标识符，就像对节点所做的那样，然后将它们link传递给节点。在

考虑Wikipedia article for hypergraphs中的示例图：

要在pygraph中创建此图形，可以执行以下操作：

from pygraph.classes.hypergraph import hypergraph
from pygraph.readwrite.dot import write_hypergraph

h = hypergraph()

h.add_nodes(['v1', 'v2', 'v3', 'v4', 'v5', 'v6', 'v7'])
h.add_hyperedges(['e1', 'e2', 'e3', 'e4'])

h.link('v1', 'e1')
h.link('v2', 'e1')
h.link('v3', 'e1')
h.link('v2', 'e2')
h.link('v3', 'e2')
h.link('v3', 'e3')
h.link('v5', 'e3')
h.link('v6', 'e3')
h.link('v4', 'e4')

with open('hypergraph.dot', 'w') as f:
    f.write(write_hypergraph(h))

将使用dot生成此图像输出：

我想这是一个正确的表示，但不像维基百科上的图片那样直观。如果您正在追求超图的可视化，您应该查看this question。在