Python和Rpy2：调用带有“.”的选项的绘图函数

Question

我刚刚开始学习如何在python中使用rpy2。我能画出简单的曲线图之类的，但我遇到了一个问题：R中的许多选项都使用“.”。例如，这里有一个有效的R调用：

barplot(t, col=heat.colors(2), names.arg=c("pwn", "pwn2"))

其中t是矩阵。在

我想在python中使用相同的调用，但是它拒绝名称.arg. 我的理解是，在python中，您将“.”替换为“U”，例如将其命名为“arg”，但这也不起作用。我知道这是一个基本的问题，所以我希望有人看到了这一点，并知道解决办法。谢谢！在

Answer 1

您可以在这里为命名参数（using **）使用字典作为文档中的described，并为函数直接调用R。{RPy2}也期望RPy2}。是的，这有点尴尬，但是从好的方面来说，你应该可以在rpy2中做任何你可以在R中做的事情

from rpy2 import robjects
color = robjects.r("heat.colors")()
names = robjects.StrVector(("pwn", "pwn2"))
robjects.r.barplot(t, col=color, **{"names.arg":names})

（请注意，这是针对rpy2版本2.0.x；在unreleased 2.1中有一些更改，我还没有机会查看这些更改。）

Answer 2

我不知道Rpy是否会接受这一点，但您可以在关键字参数中添加句点。不过，你得把它们通读字典。像这样：

>>> def f(**kwds): print kwds
... 
>>> f(a=5, b_c=6)
{'a': 5, 'b_c': 6}
>>> f(a=5, b.c=6)
Traceback (  File "<interactive input>", line 1
SyntaxError: keyword cant be an expression (<interactive input>, line 1)
>>> f(**{'a': 5, 'b.c': 6})
{'a': 5, 'b.c': 6}

Answer 3

对于rpy2-2.1.0，一种编写方法是：

from rpy2.robjects.packages import importr
graphics = importr("graphics")
grdevices = importr("grDevices")

graphics.barplot_default(t, 
                         col = grdevices.heat_colors(2),
                         names_arg = StrVector(("pwn", "pwn2")))

必须使用barplot_default（而不是barplot）是由于 在R's函数签名和 保存参数名转换需要 函数所包含的R代码的分析。在

更多，以及一个执行系统翻译功能的例子 “.”到''uu'的位置： http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.1/html/robjects.html#functions