在python中运行Fiji脚本

Question

我试图通过调用Fiji在Python中为sun提供一个自制的Fiji脚本，但是关于如何实现它的文档很少。 我需要的是这样的东西：

    def myfijiscript:
        [CODE]

然后在Python中：

^{pr2}$

有办法吗？在

Answer 1

Python（或者确切地说，Jython）脚本是使用^{}类执行的（参见source code）。在

在从Python开始的Java实例中运行Jython脚本没有多大意义，但是请看一下关于如何在Python中运行外部命令的thosetwo问题。您可以将脚本保存在文件myscript.py中，然后执行以下操作：

call(["./ImageJ-linux64", "myscript.py"])

从命令行使用ImageJ launcher。在

另一种方法是使用ImageJ作为库，只需导入脚本所需的类，正如其他人建议的那样：

^{pr2}$