对给定列的numpy矩阵排序

Question

我尝试使用Ned Batchelder代码按人的顺序对NumPy矩阵进行排序，如下文所述：

Sort numpy string array with negative numbers?

代码在一维数组上运行，命令是：

print (sorted(a, key=natural_keys))

现在，我的问题是我的数据是一个10列的矩阵，我想根据一列对它进行排序（比如MyColumn）。我找不到一种方法来修改代码以打印按此列排序的整个矩阵。我能想到的就是：

^{pr2}$

但是，当然，只有MyColumn出现在输出中，尽管它是正确排序的。。。在

有办法打印整个矩阵吗？

下面是我用来加载数组的命令（我将原来的imputfile简化为一个3列数组）：

data = np.loadtxt(inputfile, dtype={'names': ('ID', 'MyColumn', 'length'),
'formats': ('int32', 'S40', 'int32')},skiprows=1, delimiter='\t')

ID  MyColumn    length
164967  BFT_job13_q1_type2  426
197388  BFT_job8_q0_type2   244
164967  BFT_job13_q0_type1  944
72406   BFT_job1_q0_type3   696

以下是理想情况下的输出：

ID  MyColumn    length
72406   BFT_job1_q0_type3   696
197388  BFT_job8_q0_type2   244
164967  BFT_job13_q0_type1  944
164967  BFT_job13_q1_type2  426

Answer 1

如果您有一个np.matrix，名为m：

col = 1
m[np.array(m[:,col].argsort(axis=0).tolist()).ravel()]

如果您有一个np.ndarray，称为a：

^{pr2}$

如果您有一个具有命名列的结构化数组：

def mysort(data, col_name, key=None):
    d = data.copy()
    cols = [i[0] for i in eval(str(d.dtype))]
    if key:
        argsort = np.array([key(i) for i in d[col_name]]).argsort()
    else:
        argsort = d[col_name].argsort()
    for col in cols:
        d[col] = d[col][argsort]
    return d

对于您的具体情况，您需要the following ^{} function：

def key(x):
    x = ''.join([i for i in x if i.isdigit() or i=='_'])
    return '{1:{f}{a}10}_{2:{f}{a}10}_{3:{f}{a}10}'.format(*x.split('_'), f='0', a='>')

d = mysort(data, 'MyColumn', key)