如何设置Pyrgm颜色

Question

我可以问一下Pymol是否允许用户根据用户定义的值设置atom颜色？ 例如，我想根据所有原子的生化特性来给它们着色，羽毛被认为是RGB值，比如说[RGB]等于[feature1 feature2 feature3]，我怎么可能呢 在Pymol做这个？在

另外，如果我已经给原子上色了，我能得到颜色值吗？我试着用命令行获取颜色（），但它返回的值未被识别为RGB color，是否还有其他值 我可以调用Pymol中的函数来获取原子颜色？在

Answer 1

请参考pymolwiki页面Color和Set Color。在

首先，使用您的特征定义一组颜色（记住将特征值规格化为缩放[0,1]或[0,255]）：

set_color mycol1, [feature1R, feature1G, feature1B]
set_color mycol2, [feature2R, feature2G, feature2B]
...

然后可以使用自定义颜色为原子着色：

^{pr2}$

要获得原子颜色，请参考“Getting Atom Colors”。 假设你有一个名为youratom的原子，你想得到它的颜色：

atomcolor = []
iterate youratom, atomcolor.append(cmd.get_color_tuple(color))
print atomcolor[0]

atomcolor[0]是一个按比例[0,1]的RGB值的元组。在