Python，在循环中打开文件（dicom）

Question

我目前正在使用以下代码手动读取200幅dicom图像：

ds1 = dicom.read_file('1.dcm')

到目前为止，这是有效的，但我正在尝试通过创建一个循环来读取使用此代码的文件，使我的代码更短、更易于使用：

^{pr2}$

此代码当前不工作，我收到错误：

"raise InvalidDicomError("File is missing 'DICM' marker. "
dicom.errors.InvalidDicomError: File is missing 'DICM' marker. Use         
force=True to force reading

有谁能告诉我我哪里出错了吗？在

Answer 1

我认为这句话：

dicom_file = os.path.join("/",dirName,filename) 

可能是个问题？它将把这三者连接起来，形成一条以“/”为根的路径。例如：

^{pr2}$

将为您提供“/directory/file”（绝对路径），同时：

os.path.join("directory","file")

将为您提供“目录/文件”（相对路径）

如果你知道你想要的所有文件都是“*.dcm” 您可以尝试glob模块：

import glob

files_with_dcm = glob.glob("*.dcm")

这也适用于完整路径：

import glob

files_with_dcm = glob.glob("/full/path/to/files/*.dcm")

但同时，操作系统列表目录（dirName）将包括目录中的所有内容，包括其他目录、点文件等

您的存在=os.path.isfile文件（dicom_文件）行将过滤掉所有非文件，如果你使用“如果存在：”之前阅读。在

如果您知道模式，我建议使用glob方法，否则：

if exists:
   try:
      ds = dicom.read_file(dicom_file)
   except InvalidDicomError as exc:
      print "something wrong with", dicom_file

如果你做了一个尝试/例外，如果存在：有点多余，但不伤害。。。在

Answer 2

尝试添加：

dicom_file = os.path.join("/",dirName,filename) 
if not dicom_file.endswith('.dcm'):
    continue