嵌套文件读取不会在所有主循环中循环

Question

我有两个文件。
一个文件有两列，我们称之为db，另一个文件有一列，我们称之为in。
db中的第二列与in中的列类型相同，两个文件都按此列排序。
db例如：

RPL24P3 NG_002525   
RPLP1P1 NG_002526   
RPL26P4 NG_002527
VN2R11P NG_006060   
VN2R12P NG_006061   
VN2R13P NG_006062   
VN2R14P NG_006063

例如：

NG_002527
NG_006062

我希望通读这些文件并获得如下输出：

NG_002527: RPL26P4
NG_006062: VN2R13P

这意味着我在in行上迭代，并试图在db中找到匹配的行。
我为此编写的代码是：

    with open(db_file, 'r') as db, open(sortIn, 'r') as inF, open(out_file, 'w') as outF:
        for line in inF:
            for dbline in db:
                if len(dbline) > 1:
                    dbline = dbline.split('\t')
                    if line.rstrip('\n') ==  dbline[db_specifications[0]]:
                        outF.write(dbline[db_specifications[0]] + ': ' + dbline[db_specifications[1]] + '\n')
                        break

*db_specification与此问题无关，因此我没有为其复制相关代码-问题不在那里

当前代码将找到一个匹配项，并按照我在in中为第一行计划的那样编写它，但不会为其他行找到任何匹配项。我怀疑这与break有关，但我不知道该改变什么

Answer 1

我可以通过插入以下行来解决问题：
line = next(inF) 在break语句之前

Answer 2

由于db_文件中的数据按第二列排序，因此可以使用此代码读取该文件

with open("xyz.txt", "r") as db_file, open("abc.txt", "r") as sortIn, open("out.txt", 'w') as outF:

    #first read the sortIn file as a list
    i_list = [line.strip() for line in sortIn.readlines()]

    #for each record read from the file, split the values into key and value
    for line in db_file:
        t_key,t_val = line.strip().split(' ')

        #if value is in i_list file, then write to output file
        if t_val in i_list: outF.write(t_val + ': ' + t_key + '\n')

        #if value has reached the max value in sort list
        #then you don't need to read the db_file anymore
        if t_val == i_list[-1]: break

输出文件将包含以下项：

NG_002527: RPL26P4
NG_006062: VN2R13P

在上面的代码中，我们必须先阅读排序列表。然后读取db_文件中的每一行。i_list[-1]将具有sortIn file的最大值，因为sortIn文件也按升序排序

与下面的代码相比，上面的代码具有更少的i/o

=========== 以前提交的答复：

根据数据在db_文件中的存储方式，我们似乎必须读取整个文件，以对照sortIn文件进行检查。如果db_文件中的值按第二列排序，那么一旦找到sortIn中的最后一项，我们就可以停止读取该文件

假设我们需要从文件中读取所有记录，看看下面的代码是否适合您

with open("xyz.txt", "r") as db_file, open("abc.txt", "r") as sortIn, open("out.txt", 'w') as outF:

    #read the db_file and convert it into a dictionary
    d_list = dict([line.strip().split(' ') for line in db_file.readlines()])

    #read the sortIn file as a list
    i_list = [line.strip() for line in sortIn.readlines()]

    #check if the value of each value in d_list is one of the items in i_list
    out_list = [v + ': '+ k for k,v in d_list.items() if v in i_list]

    #out_list is your final list that needs to be written into a file
    #now read out_list and write each item into the file
    for i in out_list:
        outF.write(i + '\n')

输出文件将包含以下项：

NG_002527: RPL26P4
NG_006062: VN2R13P

为了帮助您，我还打印了d_列表、i_列表和out_列表中的内容

d_列表中的内容如下所示：

{'RPL24P3': 'NG_002525', 'RPLP1P1': 'NG_002526', 'RPL26P4': 'NG_002527', 'VN2R11P': 'NG_006060', 'VN2R12P': 'NG_006061', 'VN2R13P': 'NG_006062', 'VN2R14P': 'NG_006063'}

i_列表中的内容如下所示：

['NG_002527', 'NG_006062']

从out_列表写入out文件的内容如下所示：

['NG_002527: RPL26P4', 'NG_006062: VN2R13P']