我试图使用nextflow从python脚本中获得一些并发性,这样我的一些数据流就不会使用传统的nextflow理念
在我的第一个过程中,我通过调用python脚本创建文件,在我的第二个过程中,我希望使用创建的文件
我创建了一个新的通道,用于监视创建文件的路径,但似乎什么都没有发生。我使用.fromPath方法进行了测试,我的过程是成功的,所以我不确定出了什么问题
mutFiles = Channel.watchPath(launchDir + '/output/mutFiles/*.mutfile')
process structurePrediction{
input:
file mutFiles
output:
stdout results
"""
test.py ${mutFiles}
"""
}
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