Python：如何用直线替换圆内的曲线点？

Question

我有以下问题。如果你看下图，你会看到一个圆形DNA链的显微图像，称为泪珠。最初的骨骼化（morphology.skeletonize）产生了红色的痕迹。轨迹是形状（N，2）的nd数组，其中N是轨迹中的点数。在orange中，在我应用了某种改进算法（我自己设计的）之后，跟踪了串。现在，如你所见，在明亮区域周围，轨迹有点扭曲，与真实形状不相似。为了解决这个问题，我想做以下工作：

1. 定义固定的蓝点周围的半径（即5纳米）
2. 删除该半径范围内的所有轨迹点（我的问题）
3. 删除这些点后，将蓝色圆点与圆外的第一个点连接

最后，我不知道如何告诉Python，对于给定的坐标数组，我希望删除位于图像区域内的所有坐标。如前所述，该区域是一个围绕蓝点的圆