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字典的循环
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<p><strong>编辑以下内容</strong></p> <p>我有一本大字典,里面有很多关于集群及其基因的信息。我正在尝试访问有关“cdhitclusters”的部分数据。这段代码工作得很好,完全符合我的要求(计算每个簇的rep_基因数)。我只是不知道如何为字典中的所有集群编写for循环</p> <pre><code>clus1 = (gene_clusters.get("cluster-1")) cdhit1 = (clus1.get("cdhitclusters")) rep1 = pd.DataFrame(cdhit1) print(len(rep1.rep_gene)) </code></pre> <p>这是字典的一部分:</p> <pre><code>{ 'cluster-1': { 'BGCid': '-', 'cdhitclusters': [ { 'genes': { 'AT1G24070': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24070' }, { 'genes': { 'AT1G24100': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24100' }, { 'genes': { 'AT1G24040': 100.0, 'AT1G2404_1': 100.0, 'AT1G2404_2': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24040' }, { 'genes': { 'AT1G24020': 100.0, 'AT1G2402_1': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24020' }, { 'genes': { 'AT1G24010': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24010' }, { 'genes': { 'AT1G24000': 100.0 }, 'rep_gene': 'AT1G24000' } ] ... </code></pre> <p>有45个集群,我如何编写一个循环来完成上面的代码,但对于所有集群</p> <p><strong>已更新</strong></p> <p>谢谢你的回答,他们成功了。我希望它输出到一个数据帧,我可以添加到一个更大的数据帧。这是我正在使用的代码,但它只计算循环中第一个集群的CDhit。我做错了什么</p> <pre><code>for clus in gene_clusters.values(): cdhit = (clus.get("cdhitclusters")) rep = pd.DataFrame(cdhit) replen = rep.iloc[:,0] replen1 = len(rep.rep_gene) list = [replen1] replen2 = pd.DataFrame(list, columns=['CDhits']) replen2 = replen2.CDhits </code></pre>
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1 个回答
匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>我认为在这种情况下,一个简单的方法是:</p> <pre><code>for cluster in gene_clusters.keys(): #your code </code></pre> <p>我试过使用您提供的dict部分,gene_clusters.keys()生成了您想要的集群列表</p>
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