每当我使用sc.pp.neighbors(adata)
时,我都会收到以下消息(没有任何错误):
我有:
scanpy==1.8.1
pynndescent==0.5.4
numba==0.54.0
umap-learn==0.5.1
anndata==0.7.6
我的数据集只包含约20000个单元格,所以我的内核使用这个相对较小的数据集死亡是非常奇怪的
我甚至尝试使用scanpy的bbknn
函数作为替代,我的内核也死了
我还遇到了与github上的问题相同的问题:https://github.com/theislab/scanpy/issues/1567,但它还没有解决方案
我试图在cmd而不是jupyter笔记本上运行代码,但出现了下一个错误:
LLVM ERROR: Symbol not found: __svml_sqrtf8
我应该怎么做才能正确运行此函数
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