将参数从Mac上的JuPyter笔记本传递到R脚本，反之亦然？

Question

我有一个JuPyter笔记本（Python），希望将参数列表传递到R程序（单独存储在同一目录中）。在R程序执行后，它将把结果传回JuPyter笔记本

我在macOS上

因此，我的问题如下：

1. 如何将参数从JuPyter（Python）传递到R？我尝试过使用subprocess.Popen，但它似乎不起作用

    command = "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R"
    script = "/Users/me/Desktop/rProgram.R"
    args = [1,2,3] # some arguments to pass to R
    cmd = [command, script] + args
    p = subprocess.Popen(cmd, stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE)
    results = p.communicate()

看来程序没有运行。如果我打印results，我会得到：

ARGUMENT '/Users/me/Desktop/rProgram.R' __ignored__\n\n", b"Fatal error: you must specify '--save', '--no-save' or '--vanilla'\n")

1. 我的第二个问题是，如何让R程序在JuPyter中将一些变量传回Python？或者等效地，如何让Python从R程序中获取这些变量

Answer 1

发现上面我的目录中有一些错误。在Mac上，Rscript路径被指定为/Library/Frameworks/R.framework/Versions/Current/Resources/Rscript。我在上面的原始代码中使用的路径似乎不会运行R的实例

1. 在Python方面：

command = "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/Current/Resources/Rscript"
script =  "/Users/me/Desktop/rProgram.R"
args = [1,2,3] # some arguments to pass to R
cmd = [command, script] + args

x = subprocess.check_output(cmd, universal_newlines = True, stderr = subprocess.STDOUT)

x是从rProgram.R脚本传回的必需参数

1. 在R侧：

# Retrieve arguments from Python
args <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)

# Perform some functions
some.value <- some.function(args)

# Passing the value back to Python
cat(some.value)